تم ادارة المعهد من قبل مجلس المعهد والذي يضم في عضويته رؤساء الاقسام العلمية ومعاونو العميد اضافه الى ممثل نقابة المعلمين وممثل اتحاد الطلبة ويرأس المجلس عميد المعهد
مجلس المعهد
مجلس المعهد أعلى سلطه بالمعهد يتكون من مجموعه من الاعضاء هم رؤساء الاقسام العلميه ورئيس المجلس هو عميد المعهد . للمجلس مهام و صلاحيات علمية وادارية ومالية واسعة
المهام العلمية
* رسم سياسة المعهد بما ينسجم و السياسة ألعامة لهيئة التعليم التقني و تحقيق رسالتها
* إعداد خطة القبول في الدراسات ألأولية في أقسام المعهد
* إعداد خطة البحث العلمي و التأليف و الترجمة لأقسام المعهد
* التوصية باستحداث الأقسام و الفروع العلمية أو دمجها أو إلغائها
* النظر في خطط الأقسام ألعلميه بشأن دعوة الاساتذه الزائرين والمؤثرات والندوات ألعلمية وألايفادات وألتفرغ و التوصيه بشأنها إلى رئيس الهيئة لآستحصال الموافقة
* اقرار نتائج الامتحانات بعد رفعها من قبل الأقسام ألعلمية
* اقرار ألترقية ألعلمية لعضو الهيئة التدريسية (مدرس أستاذ مساعد) ورفعها إلى الهيئه لإصدار أمرجامعي
* التوصية إلى رئيس الهيئة بترقية عضو الهيئة التدريسية إلى مرتبة ألأستاذية بعد استكمال إجراءاتها من لجنة الترقيات
* الموافقه على تأجيل ألسنه الدراسية لطلبة المعهد بعد توفر المبررات
* المهام الأدارية الأشراف على شؤون المعهد ومتابعة كافة نشاطاته
* إعداد الملاك التدريسي للمعهد
* إعادة النظر بعناوين الفنين والإداريين
* تشكيل لجان تساعد على اداء مهمات المعهد ألعلمية، والادارية،و ألتربوية
* التوصية بمعاقبة التدريسيين والموظفين حسب القانون النافذ أو إبطال العقوبة
* التوصية بإحالة أي منتسب من المعهد إلى المحاكم ألمختصة نتيجة لمخالفتهم أحكام القانون
* المهام المالية اقتراح خطة الموازنة السنوية , الاستيراد , الاستثمار ورفعها إلى رئيس الهيئة لتوحيدها مع المعاهد الأخرى
* التوصية للهيئة بإقرار الحسابات الختامية للمعهد
* مراجعة تقرير ديوان ألرقابه ألمالية الخاص بالمعهد وإبداء الرأي فيه
* تخويل عميد المعهد بعض الصلاحيات
العميد
يتم اختيار العميد كشخصيه علميه واداريه وتربويه من قبل وزير التعليم العالي والبحث العلمي حيث يجب ان تتصف شخصية العميد بمجموعه من المواصفات والسمات القياديه اضافه الى الشهاده واللقب العلمي
اسماء العمداء الذين تسنموا ادارة المعهد منذ تأسيسة ولحد الان:
| ت | اسم العميد | الشهادة | الأختصاص | المرتبة العلمية | من | الى |
| 1 | د. خليل ابراهيم العنبكي | دكتوراه | طب بيطري | استاذ مساعد | 15/10/1981 | 2/6/1984 |
| 2 | د. جميل محمد سعيد | دكتوراه | انتاج حيواني | استاذ مساعد | 9/1/1985 | 1/8/1991 |
| 3 | د. رياض محمد عبد الله | دكتوراه | اقتصاد زراعي | استاذ مساعد | 16/1/1992 | 23/9/2001 |
| 4 | السيد محمد شكير محمود | دبلوم عالي | محاسبة | مدرس | 24/9/2001 | 23/5/2003 |
| 5 | د. عباس محمد جواد عباس | دكتوراه | طب بيطري | استاذ مساعد | 24/5/2003 | 29/8/2003 |
| 6 | د. عبد الهادي صلال محمد | دكتوراه | طب بيطري | استاذ مساعد | 30/8/2003 | 23/12/2003 |
| 7 | السيد شاكر شناوة صالح | ماجستير | صيدلة | استاذ مساعد | 24/12/2003 | 26/2/2005 |
| 8 | د. فاضل عبد العباس عبد الحسين | دكتوراه | احصاء | استاذ مساعد | 27/3/2005 | 29/12/2014 |
| 9 | د. ابراهيم عبد موسى السعبري | دكتوراه | احصاء | استاذ مساعد | 10/1/2014 | 4/8/2014 |
| 10 | د. تحسين علي البدري | دكتوراه | ميكانيك | مدرس | 4/8/2014 | 30/10/2016 |
| 11 | أ.د. أنغام جاسم محمد علي | دكتوراه | احياء مجهرية | استاذ | 30/10/2016 | 08/01/2019 |
| 12 | أ.م.د. شكرية شدهان جياد العكيلي | دكتوراه | تمريض | استاذ | 08/01/2019 | مستمرة لحد الان |
